如果深入金字塔内部，金字塔结构又可以细分为3种子结构：主题与子主题之间的纵向关系；子主题与子主题之间的横向关系；序言的讲故事结构。
金字塔内部的3种子结构
纵向（父子）关系：疑问/回答式对话
纵向关系上讲求结论先行,以上统下,且每一层次的思想必须是对下一层次思想的总结概括，而这组思想又为上一层次思想提供解释和支持。
读者很容易理解用金字塔结构组织的思想：先从金字塔的最顶端开始，沿着各个分支向下展开。首先表达主要思想，使读者对主要思想产生某种疑问，而主要思想（金字塔结构中）下一层次的思想将回答这些疑问。通过不断的疑问/回答式对话，读者可以了解作者的全部思想。
纵向的疑问/回答式是人类的一种自然反应。通过这种纵向联系，能够很好地吸引读者的注意力，迫使读者按照你的思路产生符合逻辑的反应。但同时需要注意，要想吸引读者的全部注意力，就必须做好回答问题的准备之前，避免引起读者的疑问；也必须在引起疑问之前，避免先给出对该问题的答案。
其次，为了保持读者的注意力，你必须保证对话与读者存在相关性，即你的对话必须能直接回答你所发现的读者头脑中已存在的疑问。
纵向（父子）关系
横向（兄弟）关系：归纳或演绎
横向关系上讲求归类分组,逻辑递进，第一条规则是每组中的思想必须属于同一逻辑范畴。第二条规则是每组中的思想必须按照逻辑顺序组织。
当上一层次提出某个思想，就会引发读者提出关于这个思想的疑问，而这一层次上，也就是横向上要回答读者心中的关于这个思想的疑问，同时还必须保证表达符合逻辑。而思想上，演绎和归纳是思考中仅有的两种逻辑关系。简单说，表达必须具有明确的演绎或归纳关系，但不可能同时具有演绎关系和归纳关系。
演绎推理只具有演绎顺序。归纳推理具有时间顺序、结构顺序和重要性顺序。这四种顺序是大脑进行分析活动仅有的四种方式:演绎推理,发现因果,化整为零和归纳总结.
横向（兄弟）关系
序言的讲故事
在展开纵向疑问/回答式对话之前，你必须能先引发出读者头脑中已有的疑问，否则无法进入纵向的疑问/回答，即无法进入你所想要讨论的主题。序言的目的就是引发出受众大脑中已有的问题，确定文章的初始问题，而这个问题的答案就是你将要表达的中心思想。
序言通常是追溯问题的起源和发展来确定这一问题，而问题的起源和发展无非是背景、冲突、疑问、答案。因此，序言是以讲故事的形式来引导读者提出头脑中已存在的问题。这样做的好处是能够确保读者在了解你的思维过程之前，读者和你是“站在同一位置上”。同时还能保证你将主要思想一定放在文章的最前面。
序言的讲故事
这3种子结构构成了完整的金字塔，它能够清晰地帮助读者了解作者表达出的全部思想。纵向的疑问/回答式对话通过结论先行和以上统下，让读者清晰地了解每一层次的思想；横向的归纳或演绎推理，通过归纳分组和逻辑递进，让读者理解每一层次思想的合理性；序言的讲故事吸引和保持了读者的注意力，保证了“对话”的顺利展开。
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